У1988 р. було створено Міжвідомчу комісію, до якої увійшли спеціалісти академічних інститутів, Міністерства охорони здоров’я УРСР. Від 1988 до 1990 р. комісія здійснила низку комплексних морфологічних, етимологічних, мікробіологічних, антропометричних, рентгенологічних і біохімічних досліджень, а також особистісну ідентифікацію мощей найбільш відомих історичних осіб.

Дослідження встановили, на які хвороби страждали чорноризіи, у кого з них були прижиттєві травми й у кого травми прислужилися причиною смерті.

Наприклад, дослідження мощей билинного героя-богатиря прп. Іллі Муромця показали, що він вирізнявся високим, як на ті часи, зростом — 177 см, а також богатирською силою ("виключним розвитком м’язової системи"). Водночас з’ясувалося: він тривалий час потерпав від захворювання хребта, що призвело до функціональної перебудови організму. У преподобного за життя були переломи ключиці й ребер. А помер він від проникаючого поранення грудної клітки пласким кілким предметом (списом).

Багато хто з ченців страждав від різних ревматичних захворювань. Було встановлено зріст похованігх та їхній приблизний вік на момент смерті. З усіх похованих у Ближніх печерах найнижчим виявився Микола Святоша — 153 см. Помер він у віці близько 70 років (немалий вік як для середньовіччя).